Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
67606	Cc1cc(NC(=O)CO)cc(C2=CC(CN)(C(=O)O)NC=N2)c1	TargetDiff	2Z3H	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
67607	N=CN(CN)C1=CCN2C(=N1)NC(CNCO)=C2CC(O)C(O)CCO	TargetDiff	2Z3H	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
67608	CC1(O)NCCC(C(=O)CC(CNC(=O)C(O)CO)S(O)(O)C(O)CCO)N1	TargetDiff	2Z3H	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
67609	CC1CN=C(CC2C(C)C(O)C(O)C2c2ccnc(C(N)=O)c2)N1	TargetDiff	2Z3H	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
67610	CC(=O)NC(CF)CC1CNC2=C3CN4CC(=O)CC4=CC=C3C(C(Nc3ccccc3)C(=O)O)C=C21	TargetDiff	2Z3H	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
67611	N#CNCc1cc(C(=O)O)cc(N2CNC(=N)N2)c1	TargetDiff	2Z3H	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
67612	NCC(=O)CCC(CCC(=O)O)C1COC(C(O)O)C1O	TargetDiff	2Z3H	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
67613	CC1C(C2CC(CCNCN)C3OC(O)CC(C(=O)O)C(O)C23)C2(O)CC3(C(O)CC13O)C(C)O2	TargetDiff	2Z3H	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔
67614	COC1=CC(C(CC(=O)N(CO)C(N)=O)C2=NC3N=CNC(=N)C3=C(O)CC2)C=CC1=N	TargetDiff	2Z3H	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
67615	CC(=N)C1C(=O)C(C)CC1(CO)C1CN(CC2OC(O)C(O)C2O)C2=C1OC(C(O)C(F)F)C2	TargetDiff	2Z3H	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
67616	CCCC(CC(=O)O)N(C1C=CC(C(O)C(C)N)C=C1)C1CCC(F)C1	TargetDiff	2Z3H	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
67617	CC(CC(=O)C(CO)C1COCC1O)C1(F)CC2OC(C)(C)C3C2CCC(C(=O)OC2CNC(=O)C2)C31C	TargetDiff	2Z3H	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔
67618	COc1ccc2c(c1)C1(OC(C)N(O)CC1CC(=O)O)C1N=CC(C)(C(O)C(N)=O)N(O)CN21	TargetDiff	2Z3H	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
67619	CC(C(=O)O)N1NC(C(=C=C2C=CC(O)=CC2)C2CCC(=N)N2)CC1=O	TargetDiff	2Z3H	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
67620	NNC(=O)Nc1ccc(S(O)(O)O)c(CC(=O)C(NC(O)(O)CF)C(F)F)c1	TargetDiff	2Z3H	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

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