Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
67726	CCCC1CC(C2C3CC4CC3CC42C(O)(O)CO)C(Nc2ccccn2)S1	TargetDiff	4M7T	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
67727	CCCC1=C(C2CC(Cl)=C(OCC)N2)C=CCC(N(O)O)=C1	TargetDiff	4M7T	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
67728	O=C1NC2C(=C1Cl)C(O)C(F)C(O)C2C(=O)S	TargetDiff	4Z1E	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
67729	CC1=C(C(C(O)(F)F)C(F)(F)F)C2=C(CNC2O)CC1N(C)C	TargetDiff	4Z1E	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
67730	NC(CO)C1=C(Cl)SC(S(N)([O])[O])C1=O	TargetDiff	4Z1E	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
67731	O=P(O)(O)c1cccc(O)c1O	TargetDiff	4Z1E	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
67732	O=C1C2=C=C3C(=C=C4C(=[S]C(F)C(F)(F)C4F)N(O)C4CCC(CC1O)C34)C=CC2	TargetDiff	4Z1E	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
67733	Oc1cccnc1NC1=C2C=CCC=C2C(S(O)(O)O)N1	TargetDiff	4Z1E	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
67734	CCC1CCC(O)OC(=O)C2OC3OC(=O)C4CCC(=C4C3O2)OC1	TargetDiff	4Z1E	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
67735	O=C(O)CCc1cncc2c1OC1=CC=CCC1=C2O	TargetDiff	4Z1E	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
67736	O=C1C2=C(C(C(=O)O)CC2)C(O)(O)/N=C2\C=CCC=C\C2=N/C=C\Cc2cccc1c2	TargetDiff	4Z1E	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
67737	O=C(c1ccc(F)cc1F)C(F)(F)F	TargetDiff	4Z1E	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
67738	Cc1ccc(CNCNC(=O)COCc2cccc(N)c2)cc1	TargetDiff	4XU3	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
67739	CC(O)(O)N1CC=C(CCNC(CCC(=O)O)CCC(=O)O)CC1	TargetDiff	4XU3	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
67740	C1=CN2CN=C3NNC(=C32)N1CC1COCCO1.O=C(COCC(O)(C(=O)O)C(=O)O)OC(=O)COP(=O)(O)O	TargetDiff	4XU3	✖	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

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