Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
67786	CC(O)C1=CC2C=C3OCC(C4(O)CCC5CCC(C5)C4)=C3C=C2N=N1	TargetDiff	5FTG	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
67787	CCCCC1(O)NC2C(CCC(O)C34CC(CCC)(CCC3C)CC4C2O)CC1N	TargetDiff	5FTG	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
67788	CC1CCC(OCC(C(=O)O)C2CC(CC(O)C3CCC(CO)O3)C(=O)O2)C1	TargetDiff	5FTG	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
67789	CON1CC(=O)CCC(c2ccccc2)OC(C2OC3(O)CC(CO)(N4CCC(O)C4)C(O)CC4C=CC=C2C43)C2(O)C(O)C(C(=O)O)C(C)N2C(=O)CCCO1	TargetDiff	5FTG	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
67790	CCC(C)(O)N1CCC2C3C=CC=C(O)C3CN3CCCCC(CCCC4=CC=CC1C42)C3	TargetDiff	5FTG	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
67791	CC1=CC2=CC=CC1C(CO)C1C(C)OC3(CCCC3C3OC4=C(CC(C=C4)CC2N2CC(F)C2)C3O)C1O	TargetDiff	5FTG	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
67792	CC1NCNC2CCN(C2)C(O)(C(=O)NCCC(C)(O)O)c2ccnc(n2)CNCC(O)CO1	TargetDiff	5FTG	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
67793	CCC(=O)NC1=CCC(N2CCCC(CC)N2)=CN1O	TargetDiff	5FTG	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
67794	CCCCC(C)C1C(CO)CCC2(C1O)C1CCCC1(C)CN2C(=O)CNCC(Cl)C1CCC2=CC(O)C(C)=CC21	TargetDiff	5G61	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
67795	CCC(OCCC(C)C)C1CCC2CCC3CCC(C(O)CC(C)C(C)O)C=CC3CC21	TargetDiff	5G61	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
67796	CCC1(O)COC2OC3C(O)(O)CC4CC5C(OC6C(CC(O)CC([P](=O)O)C(O)C1)C(O)C(C)(C)C(C4C)C56)C(O)C(O)CC(O)C(CC(O)C(C)O)C(O)C(C)C(O)C(O)C3(O)C2CO	TargetDiff	5G61	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
67797	CC(O)C(C)NC(=O)NC(=O)C1C(=O)CN(C(=O)CC(O)C[P](=O)O)C1S	TargetDiff	5G61	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
67798	CCOC1C=CC(OCOC)=CC1C(CO)C(CCO)CCC(CCN)c1ccccc1	TargetDiff	5G61	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
67799	CC(=O)N(C)CC1CC2C(=O)/N=C\CS([O])([O])C(=O)CCOC(CCN)CC3OCOC3(O)C2C1.CC(=O)O	TargetDiff	5G61	✖	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
67800	CC(=O)N1COC2C(C(=O)O)OC(N)C2OC2=CC(C)C(O)=CC2C2CC(O)C(O)/C=C\C(C)C21	TargetDiff	5G61	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

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