Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
70516	O=C(OCC1CCOC1)C(Oc1cncnc1)C(O)(O)CC(O)C1CCCO1	TargetDiff	5N34	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
70517	CC[C@H](C)C1NCN(CN=C2C=N[C@H](c3ccccc3)[C@H]3CC[C@H](CO)[C@H]([C@@H](C)O)N23)[C@H]1C	TargetDiff	4JYT	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
70518	CC1CCC(=NC[C@H](CC[C@@H]2CCCC[C@H]2O)N[C@@H]2CNc3cc(F)ccc32)O1	TargetDiff	4JYT	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
70519	CN(C)[C@H]1C[C@H]2N(Cc3cc(F)cc4c3[C@H](C(=O)N4C3Cc4ccccc4C3)N2C=C2C=CC(N)=CC2)C1	TargetDiff	4JYT	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
70520	Cc1cc2cc(n1)OC(=O)CC(=O)NC(C)Cc1cc(C3C=CC4=CC(=N)N=CC4=C3)cc(c1)C(O)CO2	TargetDiff	4JYT	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
70521	COc1ccc(N=C(OCc2ccccc2)N2C=C(N([O])[O])CC[C@H]2C(=O)C2=CC=C(Cl)C(F)[C@@H]2F)cc1	TargetDiff	4JYT	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
70522	COC1C2=CC(CCC(O)C3CCCCC/C=C/C/C=C/C/C=C(/C4=C(N)CC(C)=CC4)C(N)CCC3C)C=CCC2=NC2=CCC=CC21	TargetDiff	4JYT	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
70523	CC(C)(O)C(C)(C)OC(CO)CN1/C=C2/CCC(CC3CCC(O)(NCCC(O)C(O)(CCC4C=CC(=N)N=C4)N4CC1C4)C1C=CCC(O)C(O)C1C3)O2	TargetDiff	4JYT	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
70524	CC(C#CCC#CCl)C(=O)NC(OC=O)c1ccc(O)cc1	TargetDiff	4JYT	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
70525	CC[C@@H]1CC[C@H](C(=O)O)[C@@H](CC2=C[C@@H]3C(=O)N(C4=CC=CC(N)C=C4)[C@H](SC=CC(C)C)N3N[C@H]2O)C1.N[S@@](=O)O	TargetDiff	4JYT	✖	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
70526	CC(C)C1=C2C(CC1)CC(=O)N2CC1C(=O)Nc2ccccc21	TargetDiff	5DQE	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
70527	NCC1C2CCC3=C2C(OCC(C(=O)O)C2C=CC=CC21)c1ccccc1O3	TargetDiff	5DQE	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
70528	CC1C(=N)N(CC2COC3=C2CC=CC3)c2ccccc21	TargetDiff	5DQE	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✖	✖	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
70529	Oc1cccc2cccc(C3CC(O)C(O)C4C(=N3)C=CCC4O)c12	TargetDiff	5DQE	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
70530	CCC(C)C(=O)O/C1=C/N=C(\N2CCCN2)C2C=CCC3=C2NC2C1=CC=CC2OCC3	TargetDiff	5DQE	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

70516 to 70530 of 73725 items. Total 4915 pages.