Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
71071	CC(CC1CN(Cc2ccccc2F)C2=C1C=C1N=CN=CC1C2)C(=O)O	TargetDiff	5FNR	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
71072	COc1ccc(N(N=C2C=C(O)C=CC2)[C@@H]2CC(=O)[C@@H]2O)cc1	TargetDiff	5FNR	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
71073	CN1Cc2ccc3c(c2)CCC(O)CC(C3)ONC(=O)CC2C=C3C(=C4C=CCC=C4C3C3CC(=CC=C3F)C1=O)N=N2	TargetDiff	5FNR	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
71074	O=C1NCC(CC2C(=O)N(C(=O)c3ccc(C(=O)O)cc3)c3cc(C4CCCC4)ccc3C2Cc2ccccn2)C1=O	TargetDiff	5FNR	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
71075	CC(=O)CC1CN(C2=NC3=CCN=CC3C3CCN(CC4CC5OCC5N4)N23)C(=O)O1	TargetDiff	4UJA	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
71076	O=C1C(=CO)C(=O)N2[C@@H](O)C[C@@H](O)[C@@H](O)CCC3=CCC(Cl)=C[C@@H]3NC(=S)O[C@H]12	TargetDiff	4UJA	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
71077	CC(C)C(=O)NC1CC(N)CC(Nc2ccccn2)C1	TargetDiff	4UJA	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
71078	COC1=C=C([O])NC2=C(CC(O)C2)OCC(=N)NCS1	TargetDiff	4UJA	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
71079	CC(C)C(CO)N1C2=C3CN(CO)C4(C=C(C(=O)O)CC4)C3NC(=O)N=C2C2C3=C(CC21)C(=O)NC3	TargetDiff	4UJA	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
71080	O=C(C1CC(O)CN1C1C=c2nccnc2=NC1)N(O)c1ccc(O)cc1	TargetDiff	4UJA	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
71081	CC1C=CC2CCNC3=N[C](CC3)n3c(nc4c3CNC4)CC(O)(O)NC2=C1	TargetDiff	4UJA	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
71082	O=C1NOC2C1C=C=C(C(O)=C=CO)C(O)C(O)C(CO)C2O	TargetDiff	4UJA	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
71083	NC1C(=O)C(C(=O)N2C=CN(C3=NCNC4=C3NON4)CC2)OC1NC1C=CC=CN=C1	TargetDiff	5H5F	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
71084	CCOC1=C2CCC3CC/N=N\C(C)CCCCNC(=O)C4(O)C(O)C(O)C(/C(O)=C5/OC(=C(O5)C23)C1)C4O	TargetDiff	5H5F	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
71085	CCC1CC2(O)C(O)C(O)CN3C(=O)C/N=C4/CC5=C(OC)CCC5C4=C=C3C(O)C2C1CC1C=CCN=C1	TargetDiff	5H5F	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

71071 to 71085 of 73725 items. Total 4915 pages.