Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
71041	CC(=O)N(C1C=CCC(C=N)=C1)C(S)C(O)C(=O)NC1=NN(C)CC1	TargetDiff	3GS6	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
71042	CC1=C2OC(COP(O)O)C(O)C(O)C2C(Cl)=NC1C	TargetDiff	3GS6	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
71043	CC1C(C(=O)O)=C(CC(O)(CC(O)C(=O)CO)C(=O)O)CN1C	TargetDiff	3GS6	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
71044	CC(O)C(CC(=O)O)C(=O)OCC(C(=O)O)C(CO)C(O)CCCO	TargetDiff	3GS6	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
71045	O=C(O)CC(=O)OC1C(O)C(C(=O)O)C(=O)[SH]1C(=O)c1cccnc1	TargetDiff	3GS6	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
71046	CCC1NOC(CNSCCC(C)=O)=C1C(CC)C(=O)O	TargetDiff	3GS6	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
71047	CC1=CC2C(=C=C3C=CC=C4CN(C)NC34)C(C(O)C(=O)O)C(O)=C2C=C1	TargetDiff	3GS6	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
71048	O=C(O)C(O)(O)C(O)(O)C(CS)C(O)C(S)CCC1C=CCC=C1O	TargetDiff	3GS6	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
71049	CC1C(=O)NOCC(CO)OC(=O)C(O)COCC2CCN1C(=O)N(C)C2	TargetDiff	3GS6	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
71050	CCC1C(O)C(O)CC(O)C(O)(C(C)CCCCN)NC(=O)CC2CN1NC2=O	TargetDiff	3GS6	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
71051	CCC(O)(O)C(CCN1C(=O)CCC2=CCC=CC21)OP(=O)(O)C1OC(CCO)CC1O	TargetDiff	3GS6	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
71052	CC(C)C1OC(CO)C(C(C)(CO)C2(O)COCC=C2O)CCC1C(=O)O	TargetDiff	3GS6	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
71053	CC(CO)C(O)CC(c1ccccc1O)C(O)(NP(=O)(O)O)C(=O)O	TargetDiff	3GS6	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
71054	CC(COCC1C(C(O)CO)C(O)CC1(C)O)C(O)CC(=O)O	TargetDiff	3GS6	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
71055	O=C(CCO)NC(=O)C1NC(=O)C(OCCO)C(O)C(O)C(O)C1O	TargetDiff	3GS6	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

71041 to 71055 of 73725 items. Total 4915 pages.