Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
7246	Cc1cccc(C(C)Cc2ccc(-c3ccc4[nH]nc(-c5cccc(C(=O)O)c5)c4c3)cc2)c1	AlphaDrug	1DJY	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
7247	CC(Cc1ccc(-c2ccc3[nH]nc(-c4cccc(C(=O)O)c4)c3c2)cc1)c1cccc(CCCC(=O)O)c1	AlphaDrug	1DJY	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
7248	CC(Cc1ccc(-c2ccc3[nH]nc(-c4cccc(C(=O)O)c4)c3c2)cc1)c1cccc(CCN2CCCC2)c1	AlphaDrug	1DJY	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
7249	CC(Cc1ccc(-c2ccc3[nH]nc(-c4cccc(C(N)=O)c4)c3c2)cc1)c1ccccc1	AlphaDrug	1DJY	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
7250	CC(Cc1ccc(-c2ccc3[nH]nc(-c4cccc(C(=O)O)c4)c3c2)cc1)c1cc(Cl)ccc1F	AlphaDrug	1DJY	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
7251	CC(N)c1ccc(-c2n[nH]c3ccc(-c4ccc(CC(C)c5cccc(CC(=O)O)c5)cc4)cc23)cn1	AlphaDrug	1DJY	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
7252	CC(Cc1ccc(-c2ccc3[nH]nc(-c4cccc(C(=O)O)c4)c3c2)cc1)c1c(F)cccc1F	AlphaDrug	1DJY	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
7253	CC(Cc1ccc(-c2ccc3[nH]nc(-c4ccc(CN)cc4)c3c2)cc1)c1cccc(NC(=O)C2CC2)c1	AlphaDrug	1DJY	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
7254	CC(Cc1ccc(-c2ccc3[nH]nc(-c4cccc(C(=O)O)c4)c3c2)cc1)c1cccc(F)c1	AlphaDrug	1DJY	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
7255	CC(Cc1ccc(-c2ccc3[nH]nc(-c4cccc(C(=O)O)c4)c3c2)cc1)c1cccc(C(C)(C)C)c1	AlphaDrug	1DJY	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
7256	CC(N)c1ccc(-c2n[nH]c3ccc(-c4ccc(CC(C)c5cccc(CC(=O)O)c5)cc4)cc23)cc1	AlphaDrug	1DJY	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
7257	CC(Cc1ccc(-c2ccc3[nH]nc(-c4ccc(C(=O)O)cc4)c3c2)cc1)c1cccc(C(N)=O)c1	AlphaDrug	1DJY	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
7258	CC(Cc1ccc(-c2ccc3[nH]nc(-c4ccc(F)cc4)c3c2)cc1)c1cccc(NC(=O)C2CC2)c1	AlphaDrug	1DJY	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
7259	CC(Cc1ccc(-c2ccc3[nH]nc(-c4cccc(C(N)=O)c4)c3c2)cc1)c1cccc(C(=O)O)c1	AlphaDrug	1DJY	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
7260	CC(Cc1ccc(-c2ccc3[nH]nc(-c4ccc(C(=O)O)nc4)c3c2)cc1)c1cccc(C(N)=O)c1	AlphaDrug	1DJY	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

7246 to 7260 of 73725 items. Total 4915 pages.