Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
7306	CC(Cc1ccc(-c2ccc3[nH]nc(-c4cccc(C(=O)O)c4)c3c2)cc1)Cc1cccc(C(N)=O)c1	AlphaDrug	1DJY	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
7307	CC(Cc1ccc(-c2ccc3[nH]nc(-c4cccc(C(=O)O)c4)c3c2)cc1)c1cccc(OCCC(=O)O)c1	AlphaDrug	1DJY	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
7308	CC(Cc1c[nH]c2cc(OCC3CCCCC3)ccc12)c1cccc(NC(=O)C2CCCCC2)c1	AlphaDrug	1DJY	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
7309	CC(Cc1ccc(-c2ccc3[nH]nc(-c4ccc(C(N)=O)nc4)c3c2)cc1)c1cccc(C(N)=O)c1	AlphaDrug	1DJY	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
7310	CC1(c2cccc(C(=O)O)c2)CCN(Cc2ccc(-c3cc(C(=O)NC4CCCCC4)ccc3C(F)(F)F)cc2)CCO1	AlphaDrug	1DJY	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
7311	CC(Cc1ccc(-c2ccc3[nH]nc(-c4cccc(C(N)=O)c4)c3c2)cc1)c1c(F)cccc1F	AlphaDrug	1DJY	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
7312	CC(Cc1ccc(-c2ccc3[nH]nc(-c4cccc(C(=O)O)c4)c3c2)cc1)c1cccc(CCN2CCOCC2)c1	AlphaDrug	1DJY	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
7313	CC(Cc1ccc(-c2ccc3[nH]nc(-c4cccc(C(=O)O)c4)c3c2)cc1)c1cccc(OCC(F)(F)F)c1	AlphaDrug	1DJY	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
7314	CC(Cc1ccc(-c2ccc3[nH]nc(-c4cccc(C(=O)O)c4)c3c2)cc1)c1cccc(CN2CCC2)c1	AlphaDrug	1DJY	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
7315	CC(Cc1ccc(-c2ccc3[nH]nc(-c4ccncc4)c3c2)cc1)c1cccc(C(N)=O)c1	AlphaDrug	1DJY	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
7316	C#Cc1cccc(-c2n[nH]c3ccc(-c4ccc(CC(C)c5cccc(NC(=O)c6ccc(F)cc6)c5)cc4)cc23)c1	AlphaDrug	1DJY	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
7317	CC(Cc1ccc(-c2ccc3[nH]nc(-c4cccc(C(N)=O)c4)c3c2)cc1)c1cccc(CCC2CCCC2)c1	AlphaDrug	1DJY	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
7318	CC(Cc1ccc(-c2ccc3[nH]nc(-c4cccc(C(=O)O)c4)c3c2)cc1)c1cccc(C(=O)[O-])c1	AlphaDrug	1DJY	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
7319	CC(Cc1ccc(-c2ccc3[nH]nc(-c4cccc(C(=O)O)c4)c3c2)cc1)c1cccc(CCC(=O)O)c1	AlphaDrug	1DJY	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
7320	Cc1ccc(C(=O)O)cc1C(C)Cc1ccc(-c2ccc3[nH]nc(-c4cccc(C(=O)O)c4)c3c2)cc1	AlphaDrug	1DJY	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

7306 to 7320 of 73725 items. Total 4915 pages.