Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
7351	Cc1cc(-c2cnccc2-c2cnccn2)cc(Cl)c1C(=O)N1CC=NCC1	AlphaDrug	6G7A	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
7352	Cc1cc(N2CCN(c3ccnc(C(F)(F)F)c3)CC2)cc(Cl)c1C(=O)N1CCN(c2cccc(-c3ccccc3)c2)CC1	AlphaDrug	6G7A	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
7353	Cc1cc(-c2ccc(F)c(NS(=O)(=O)c3cncc(-c4ccc5ccccc5c4)c3)c2)ccc1C(=O)O	AlphaDrug	6G7A	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
7354	Cc1cc(C#N)cc(Cl)c1C(=O)N1CCN(c2cccc(-c3ccccc3)c2)CC1	AlphaDrug	6G7A	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
7355	Cc1ccc(COc2ccc3ccccc3c2)cc1	AlphaDrug	6G7A	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
7356	Cc1cc(C#N)cc(Cl)c1C(=O)N1CCN(C(=O)C2CCCC(N3C(=O)CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC(N)C3O)CC2)CC1	AlphaDrug	6G7A	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
7357	CCC(=O)N1CCC(Nc2cc(-c3ccc(F)cc3)ccc2NC(=O)c2c[nH]c3ccccc23)CC1	AlphaDrug	5N31	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
7358	CCC(=O)N1CCC(Nc2cc(-c3ccc(-c4ccc(F)cc4)cc3)cc(NCc3nnc(-c4ccccc4)o3)n2)CC1	AlphaDrug	5N31	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
7359	CCC(=O)N1CCC(Nc2cc(-c3ccc(F)cc3)cc(N)n2)CC1	AlphaDrug	5N31	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
7360	CCC(=O)N1CCC(Nc2cc(C(C)(C)O)cc(NCc3cnc(-c4cnc(C)o4)o3)n2)CC1	AlphaDrug	5N31	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
7361	CCC(=O)N1CCC(NCS(=O)(=O)c2ccc(NC(=O)c3ccc(C)cc3)cc2)CC1	AlphaDrug	5N31	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
7362	CCC(=O)N1CCC(Nc2cc(-c3ccc(N4CCN(CC(C)C)CC4)cc3)cc(NCc3nnc(-c4ccccc4)o3)n2)CC1	AlphaDrug	5N31	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
7363	CCC(=O)N1CCC(Nc2cc(-c3ccc(-c4ccc(C(=O)NO)cc4C)cc3)cc(NCc3nnc(-c4ccccc4)o3)n2)CC1	AlphaDrug	5N31	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
7364	CCC(=O)N1CCC(Nc2cc(-c3ccc(-c4ccc(C)cc4)cc3)cc(NCc3nnc(-c4ccccc4)o3)n2)CC1	AlphaDrug	5N31	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
7365	CCC(=O)N1CCC(Nc2cc(-c3ccc(C(C)(C)O)cc3C)cc(NCc3nnc(-c4ccccc4)o3)n2)CC1	AlphaDrug	5N31	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

7351 to 7365 of 73725 items. Total 4915 pages.