Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
7786	Cc1cc(-c2ccc(-c3ccccc3)s2)cc(NC#CC2CCCC2)n1	AlphaDrug	4U73	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
7787	Nc1ncc(-c2ccc(S(=O)(=O)N3CCCC3C(=O)NCCCCCCCC(=O)N3CCCC3)cc2)s1	AlphaDrug	4U73	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
7788	O=C(Nc1cc(-c2ccc(N3CCN(S(=O)(=O)c4ccccn4)CC3)cc2)ccc1C(F)(F)F)C1CC(O)C1	AlphaDrug	4U73	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
7789	Cc1cc(N)cc(N2C=CN(C(=O)OCc3ccc(N4CCOCC4)cc3)CC2)n1	AlphaDrug	4U73	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
7790	Cc1cc(N)ccc1-c1ccc(S(=O)(=O)N2CCCC2C(=O)NOC(=O)c2ccc(N3CCN(C)CC3)cc2)s1	AlphaDrug	4U73	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
7791	Cc1cc(-c2ccc(-c3ccccc3)s2)nc(NC2CCCCC2)n1	AlphaDrug	4U73	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
7792	Cc1ccc(S(=O)(=O)N2CC=CCC2C(=O)Nc2cc(S(N)(=O)=O)ccn2)cc1	AlphaDrug	4U73	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
7793	OC1CC(OC(Nc2cc(-c3ccc4c(c3)OCO4)ccc2C(F)(F)F)c2ccc(Cl)cc2)C1	AlphaDrug	4U73	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
7794	Cc1ccc(C(NC(=O)c2ccc(N3CCOCC3)cc2)C(=O)O)s1	AlphaDrug	4U73	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
7795	Cc1ccc(S(=O)(=O)N2CCN(c3ccc(-c4ccccc4C(F)(F)F)cc3)CC2C#N)cc1	AlphaDrug	4U73	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
7796	CC(c1[nH]nc(-c2cccc3ccccc23)c1C(F)(F)F)N(C)C(=O)c1ccc(C(C)(C)C(C)(C)C(=O)NO)cc1	AlphaDrug	5JSG	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
7797	CC(C(=O)N1CCC(c2ccc(NC(=O)c3cccc(C(F)(F)F)c3)cc2)CC1)c1cccc2ccccc12	AlphaDrug	5JSG	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
7798	CCN(C)C(=O)c1ccc(N2CCN(C(=O)N(C)C)CC2)c(C(=O)Nc2cccc3ccccc23)c1	AlphaDrug	5JSG	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
7799	CC(C)CN(CC(N)C(=O)N1COC(c2cccc3ccccc23)C1)C(=O)NCCCN(C(=O)OC(C)C)C(=O)C(=O)NCCCN(C)CCOc1ccc(Cl)cc1	AlphaDrug	5JSG	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
7800	CCCN(CC)C(=O)c1ccc(Nc2cc(C(=O)O)sc2C(N)=O)cc1C(F)(F)F	AlphaDrug	5JSG	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

7786 to 7800 of 73725 items. Total 4915 pages.