Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
7726	Clc1cccc(-n2cnc(-c3ccc(N4CCN(C5CC5)CC4)cc3)n2)c1	AlphaDrug	5QTT	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
7727	Clc1cc2cc(-n3cnc4ccc(-c5ccccc5)cc43)ccc2s1	AlphaDrug	5QTT	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
7728	O=C(Nc1c(-c2ccc(OC(F)(F)F)c(Cl)c2)nnn1-c1ccccc1)c1ccc(Cl)cc1	AlphaDrug	5QTT	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
7729	O=C(O)c1cnc(C2CCCC2)c(Cl)c1C1CCCCC1	AlphaDrug	6SZP	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
7730	O=C(O)c1cc(O)cc(O)c1C(=O)c1cc(O)c(O)c(O)c1	AlphaDrug	6SZP	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
7731	O=C(NC1c2ccccc2C2(CCCC2)NC2CCC1C2)c1cc(Cl)cc(-c2ccc(O)c(C(=O)O)c2)c1	AlphaDrug	6SZP	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
7732	O=C(O)c1cc(-c2cn(C3CCCC3)c(-c3ccc(Cl)c(Cl)c3)n2)ccn1	AlphaDrug	6SZP	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
7733	Cc1ccc(-c2ccc3cc(O)c(O)c(O)c3c2O)cc1O	AlphaDrug	6SZP	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
7734	O=C(c1cc(Cl)ccc1OC(F)(F)F)C(O)c1cccc(OCC2CCCCC2)c1	AlphaDrug	6SZP	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
7735	O=C(c1cc(-c2ccc(C(F)(F)F)cc2)ccc1O)C(O)c1cccc(O)c1	AlphaDrug	6SZP	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
7736	O=C(O)c1cc(O)cc(O)c1C(=O)c1cc(O)cc(C(F)(F)F)c1	AlphaDrug	6SZP	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
7737	O=C(CCc1c(O)cc(O)cc1C(=O)O)c1cc(O)c(O)c(O)c1	AlphaDrug	6SZP	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
7738	COc1ccc(-c2cc3ccc(C(c4ccc(C(=O)O)cc4)c4cccc(C(F)(F)F)c4)cc3o2)cc1	AlphaDrug	5VOJ	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
7739	COc1ccc(Oc2ccc3ccccc3c2C)cc1N1C(=O)NOC(=O)c2cc(O)cc(O)c21	AlphaDrug	5VOJ	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
7740	COc1cccc(Oc2ccc(NC(=O)C3CC3)cc2C(=O)N(C(=O)Nc2ccc(C(=O)O)cc2)C2CCCCC2)c1	AlphaDrug	5VOJ	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

7726 to 7740 of 73725 items. Total 4915 pages.