Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
9541	CC(C)(C)c1ccc(S(=O)(=O)NC2CCN(c3nc4c(C(F)(F)F)ccc(Cl)c4[nH]3)CC2)cc1	AlphaDrug	5ECT	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
9542	Cn1c(N2CCCC(NS(=O)(=O)c3ccc(C(C)(C)C)cc3)CC2)nc2ccccc21	AlphaDrug	5ECT	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
9543	Cc1cc(C(C)(C)C)c(OC2CCCCC2)nc1NC1CCN(S(=O)(=O)C2CC2)CC1	AlphaDrug	5ECT	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
9544	CC(C)(C)c1ccc(S(=O)(=O)NC2CCN(C(=O)c3ccc(C(F)(F)F)cc3)CC2)cc1	AlphaDrug	5ECT	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
9545	CC(Nc1nc2ccccc2n1Cc1ccccc1)c1ccc(C(=O)O)cc1	AlphaDrug	5ECT	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
9546	CC(C)(C)c1ccc(S(=O)(=O)NC2CCN(c3ccc(S(N)(=O)=O)cc3)CC2)cc1	AlphaDrug	5ECT	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
9547	CC(C)(C)c1ccc(S(=O)(=O)NC2CCN(C(=O)c3nnn(-c4ccccc4)c3C3CC3)CC2)cc1	AlphaDrug	5ECT	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
9548	CC1CC(NS(=O)(=O)c2ccc(C(C)(C)C)cc2)CCN1C(=O)C(F)(F)F	AlphaDrug	5ECT	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
9549	CC(NC(=O)C(N)Cc1ccc(O)c(NC(=O)NC(Cc2ccc(-c3ccccc3)cc2)C2CC2)c1)C(C)(C)O	AlphaDrug	4U5O	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
9550	CC(NC(=O)C(N)Cc1ccc(O)c(NC(=O)NC(Cc2ccc(-c3ccccc3)cc2)C(=O)O)c1)c1ccccc1	AlphaDrug	4U5O	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
9551	CC(NC(=O)C(N)Cc1ccc(O)c(NC(=O)NC(Cc2ccc(C(F)(F)F)cc2)c2ccccc2)c1)C(N)=O	AlphaDrug	4U5O	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
9552	CC(NC(=O)C(N)Cc1ccc(O)c(NC(=O)NC(Cc2ccc(-c3cnn[nH]3)cc2)C(F)(F)F)c1)c1ccccc1	AlphaDrug	4U5O	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
9553	Cc1ncn(-c2ccc(CC(NC(=O)Nc3cc(CC(N)C(=O)NC(C)c4ccccc4)ccc3O)C(C)(C)C)cc2)n1	AlphaDrug	4U5O	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
9554	CC(NC(=O)C(N)Cc1ccc(O)c(NC(=O)NC(Cc2ccc(-c3ccccn3)cc2)C(=O)O)c1)c1ccccc1	AlphaDrug	4U5O	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
9555	CC(NC(=O)C(N)Cc1ccc(O)c(NC(=O)NC(Cc2ccc(-c3ccccc3)cc2)C(=O)O)c1)c1ccccc1	AlphaDrug	4U5O	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

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