Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
9601	CN(C(=O)C1CCC(NC(=O)c2ccc(-c3ccccc3)nc2)C2CCCN(C1)C2)C1CC1	AlphaDrug	4M7T	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
9602	CN(C(=O)c1cccc(-c2cc(C(F)(F)F)cc(C(F)(F)F)c2)n1)C1CCCCC1	AlphaDrug	4M7T	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
9603	CN(C(=O)OCc1ccccc1)c1cccc(-c2cccc(Nc3nccc(N4CCN(C(=O)CC5CC5)CC4)n3)c2)c1	AlphaDrug	4M7T	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
9604	CN(C(=O)OCc1ccccc1)c1cccc(-c2cccc(NS(=O)(=O)c3ccccc3)c2)c1	AlphaDrug	4M7T	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
9605	CN(C(=O)c1cccc(-c2cccc(NS(=O)(=O)Cc3ccccc3)c2)n1)C1CCCCC1	AlphaDrug	4M7T	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
9606	CN(C(=O)c1cccc(-c2cccc(C3CCN(C(=O)NCC(C)(C)C)CC3)c2)n1)C1CCCCC1	AlphaDrug	4M7T	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
9607	CN(C(=O)OCc1ccccc1)c1cccc(-c2cccc(NS(=O)(=O)c3cccc(Cl)c3)n2)c1	AlphaDrug	4M7T	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
9608	CN(C(=O)OCc1ccccc1)c1cccc(-c2cccc(NCc3cccnc3)c2)c1	AlphaDrug	4M7T	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
9609	CN(C(=O)OCc1ccccc1)c1cccc(-c2cccc(NS(=O)(=O)c3ccc(Cl)cc3)c2)c1	AlphaDrug	4M7T	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
9610	CN(C(=O)OCc1ccccc1)c1cccc(-c2cccc(NS(=O)(=O)c3ccccc3)n2)c1	AlphaDrug	4M7T	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
9611	CN(C(=O)OCc1ccccc1)c1cccc(-c2cccc(NS(=O)(=O)c3ccccc3C(F)(F)F)c2)c1	AlphaDrug	4M7T	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
9612	CN(C(=O)c1cccc(Nc2nc(C3CC3)nc(N3CCOCC3)n2)c1)C1CCCCC1	AlphaDrug	4M7T	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
9613	CN(C(=O)c1cccc(-c2cccc(NS(=O)(=O)c3ccc(Cl)cc3)c2)n1)C1C=CCCC1	AlphaDrug	4M7T	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
9614	CN(C(=O)OCc1ccccc1)c1cccc(-c2cccc(NS(=O)(=O)c3c(Cl)cccc3C(F)(F)F)c2)c1	AlphaDrug	4M7T	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
9615	CN(C(=O)OCc1ccccc1)c1cccc(-c2cccc(NS(=O)(=O)c3cccc(CN4CCN(C5CC5)CC4)c3)c2)c1	AlphaDrug	4M7T	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

9601 to 9615 of 73725 items. Total 4915 pages.