Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
9751	Cc1c(-c2ccccc2)n(Cc2ccc(-c3ccccc3)cc2)c2ccc(N3CCN(C(=O)C4CC4)CC3)cc12	AlphaDrug	6G2L	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
9752	Cc1c(-c2ccccc2)n(Cc2cccc(-c3ccccc3)c2)c2cccc(-c3ccccc3)c12	AlphaDrug	6G2L	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
9753	Cc1c(-c2ccccc2)n(Cc2ccc(-c3ccccc3)cc2)c2ccc(-c3ccccc3)cc12	AlphaDrug	6G2L	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
9754	Cc1c(-c2ccccc2)n(Cc2ccc(-c3nc(N4CCNCC4)ns3)cc2)c2ccccc12	AlphaDrug	6G2L	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
9755	Cc1c(CNC(=O)c2cccc(N3CCN(C(=O)C(F)(F)F)CC3)c2)c(-c2ccccc2)cc2cnccc12	AlphaDrug	6G2L	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
9756	Cc1c(-c2ccccc2)n(Cc2ccc(-c3ccccc3)cc2)c2cccc(/C=C/C(N)=N\NO)c12	AlphaDrug	6G2L	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
9757	Cc1ccc(S(=O)(=O)Nc2cccc(-c3cccc(CC(=O)Nc4ccc(-c5ccccc5)cc4)c3)c2)cc1	AlphaDrug	5M5D	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
9758	Cc1ccc(S(=O)(=O)Nc2cccc(-c3cccc(NC(=O)c4ccc5ccccc5n4)c3)c2)cc1	AlphaDrug	5M5D	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
9759	Cc1ccc(S(=O)(=O)Nc2cccc(-c3cccc(CNC(=O)CN4CCCCC4)c3)c2)cc1	AlphaDrug	5M5D	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
9760	Cc1ccc(S(=O)(=O)Nc2cccc(-c3cccc(CNC(=O)c4ccc(-c5nc(N6CCOCC6)n[nH]5)cc4)c3)c2)cc1	AlphaDrug	5M5D	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
9761	Cc1ccc(S(=O)(=O)Nc2cccc(-c3nnnn3C)c2)cc1	AlphaDrug	5M5D	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
9762	Cc1ccc(S(=O)(=O)Nc2cccc(-c3cccc(NC(=O)c4ccc5c(c4)CC(N4CCCC4)C=C5)c3)c2)cc1	AlphaDrug	5M5D	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
9763	Cc1ccc(S(=O)(=O)Nc2cccc(-c3cccc(NC(=O)c4ccc5cn[nH]c5c4)c3)c2)cc1	AlphaDrug	5M5D	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
9764	Cc1ccc(S(=O)(=O)Nc2cccc(-c3cccc(NC(=O)c4ccc(N5CCOCC5)cc4)c3)c2)cc1	AlphaDrug	5M5D	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
9765	Cc1ccc(-n2nc(-c3ccccc3)cc2NC(=O)N2CCCC2C(=O)NC2CCCCCC2)cc1	AlphaDrug	5M5D	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

9751 to 9765 of 73725 items. Total 4915 pages.