Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
9706	CC(C)CC(NC(=O)C(Cc1cccc(-c2ccccc2)c1)NC(=O)c1ccccc1)C(=O)NC(C)C(N)=O	AlphaDrug	4Z1E	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
9707	CC(NC(=O)c1cnc2c(c1)[nH]c1cc(-c3ccnc4ccccc34)ccc12)c1ccc(C(=O)O)cc1	AlphaDrug	6UD2	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
9708	CC(NC(=O)c1cnc2c(c1)[nH]c1cc(-c3ccnc4ccccc34)ccc12)c1ccccc1	AlphaDrug	6UD2	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
9709	Cc1cc(-c2ccc3nc(N)ccc3c2)c2ncc(C(=O)NC(C)c3ccccc3)cc2c1	AlphaDrug	6UD2	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
9710	CC(=O)Nc1cccc(-c2ccc3c(c2)[nH]c2cc(C(=O)NC(C)C4CCC(C(=O)O)CC4)cnc23)n1	AlphaDrug	6UD2	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
9711	CC(NC(=O)c1cnc2c(c1)[nH]c1cc(-c3ccnc4ccccc34)ccc12)c1cccc(C(=O)O)c1	AlphaDrug	6UD2	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
9712	CC(NC(=O)c1cnc2c(c1)[nH]c1cc(-c3ccnc4ccccc34)ccc12)c1ccccc1CNC(=O)c1ccccc1	AlphaDrug	6UD2	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
9713	CC(=O)Nc1cccc(C(C)NC(=O)c2cnc3c(c2)[nH]c2cc(-c4ccnc5ccccc45)ccc23)n1	AlphaDrug	6UD2	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
9714	CC(NC(=O)c1cnc2c(c1)[nH]c1ccc(-c3ccc(C(=O)O)cc3)cc12)c1c(F)cccc1F	AlphaDrug	6UD2	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
9715	Cc1nc2ccc(-c3cccc4cc(C(=O)NC(C)c5ccccc5)cnc34)cc2n1CC(C)C	AlphaDrug	6UD2	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
9716	CC(NC(=O)c1cnc2c(c1)[nH]c1cc(-c3ccncc3OCC(=O)O)ccc12)c1ccccc1	AlphaDrug	6UD2	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
9717	Cc1ccc2cc(C(=O)Nc3ccc(S(=O)(=O)N4CCC(NS(=O)(=O)c5cccc(Cl)c5)CC4)cc3)oc2n1	AlphaDrug	4POX	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
9718	Cc1ccc(S(=O)(=O)N2CCC(Nc3nc(-c4cccc(Cl)c4)n[nH]3)CC2)cc1	AlphaDrug	4POX	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
9719	Cc1ccc(-c2ccc(C(=O)Nc3cccc(Cl)c3)cc2)cc1OCCC1CCCCC1	AlphaDrug	4POX	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
9720	Cc1cccc(Cn2cc(-c3cccc(C(=O)NCCCO)c3)nn2)c1	AlphaDrug	4POX	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

9706 to 9720 of 73725 items. Total 4915 pages.