Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
991	Cc1ccc(OC(=O)N2CCC(c3ccc(CO)c(-c4ccc(-c5cnccn5)cc4)c3)CC2)c(C(F)(F)F)c1	AlphaDrug	6CKS	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
992	Cc1ccc(-c2ccc(-c3ccc(-c4cccc(-c5ccc(C(=O)NC6CCCC6)cc5)c4)cc3)cc2)cc1	AlphaDrug	6CKS	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
993	Cc1ccc(OC(=O)N2CCC(c3cccc(-c4ccccc4)c3)CC2C)c2ccccc12	AlphaDrug	6CKS	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
994	Cc1ccc(OC(=O)N2CCC(c3ccc(OC(F)(F)F)cc3)CC2)c2ccccc12	AlphaDrug	6CKS	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
995	Cc1ccc(OC(=O)N2CCC(c3cccc(-c4cccc(-c5cccc(C(F)(F)F)c5)c4)c3)CC2CO)c2ccccc12	AlphaDrug	6CKS	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
996	Cc1ccc(OC(=O)N2CCC(c3cccc(-c4cccc(-c5cccc(C(F)(F)F)c5)c4)c3)CC2)n2cccc12	AlphaDrug	6CKS	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
997	Cc1ccc(OC(=O)N2CCC(c3cccc(-c4cccc(-c5cccc(Cl)c5)c4)c3)CC2)c2ccccc12	AlphaDrug	6CKS	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
998	Cc1ccc(OC(=O)c2cc(-c3ccccc3)cc(NC(=O)c3ccc(C)cc3)c2C)cc1	AlphaDrug	6CKS	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
999	Cc1cccc(-c2ccc(-c3ccc(-c4ccc(C(=O)NC5CCN(C(=O)N6CCCC6)CC5)cc4)cc3)cc2)c1	AlphaDrug	6CKS	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
1000	Cc1ccc(OC(=O)N2CC=CC(c3ccccc3)C2)c2ccccc12	AlphaDrug	6CKS	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
1001	COC(C#N)C(O)C(O)CNC(=O)c1ccc(-c2ccc(O)c(Cc3ccc(O)cn3)c2)cc1	AlphaDrug	4OAK	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
1002	COC(C(O)c1cccc(C(F)(F)F)c1)C(O)C(O)CNC(=O)c1cnc(-c2ccc(O)c(C)c2)cn1	AlphaDrug	4OAK	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
1003	COC(c1cc(C#N)ccn1)C(O)C(O)CNC(=O)c1ccc(-c2ccc(O)c(O)c2)cc1	AlphaDrug	4OAK	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
1004	COC(c1cccc(-c2cnc(C)c(Cl)n2)c1)C(O)C(O)CNC(=O)c1ccc(-c2ccc(O)cc2)cc1	AlphaDrug	4OAK	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
1005	COC(c1cccc(-c2ncnc(N)n2)c1)C(O)C(O)CNC(=O)c1ccc(-c2ccc(O)cc2)cc1	AlphaDrug	4OAK	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

991 to 1005 of 73725 items. Total 4915 pages.