Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
10606	COc1ccc(NC(=O)c2ccc(OCCN3CCN(c4cccc(C5CCN(C6CC6)CC5)c4)CC3)cc2)cc1	AlphaDrug	6E7R	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
10607	COc1cc(-c2cnc(N3CCN(C(=O)C4CCN(c5ccc(C6CCN(C7CCCC7)CC6)cc5)CC4)CC3)c(F)c2)ccn1	AlphaDrug	6E7R	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
10608	Cc1cc(OCC2CC2)c(OC2CCOCC2)cc1-c1ccc(N2CCN(C(C)C)CC2)cc1	AlphaDrug	6E7R	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
10609	COc1cc(NC(=O)NC2CCN(c3ncc(N4CCN(C)CC4)nc3C)CC2)ccc1-c1ccc(OC(F)(F)F)cc1	AlphaDrug	6E7R	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
10610	COc1cc(-c2ccc(OCCN3CCN(c4cccc(F)c4)CC3)cc2)ccc1NCc1ccccc1	AlphaDrug	6E7R	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
10611	Cc1cc(O)cc(NC(=O)c2ccc(O)cc2)c1C#Cc1ccc(O)cc1	AlphaDrug	6E7R	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
10612	COc1ccccc1CNC(=O)c1ccc(-c2cc(O)c(OC3CC3)c(OC3CC3)c2)c(OC)c1	AlphaDrug	6E7R	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
10613	COc1cc(NC(=O)C2CCN(c3nc(-c4ccc(C)c(NC(=O)NCc5ccc(F)cc5)c4)c[nH]3)C2)cc(OC)c1	AlphaDrug	6E7R	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
10614	COc1ccc(-c2cc(-c3ccc(OC4CCOCC4)cc3)cc3nc(-c4cncn4C)[nH]c23)cc1	AlphaDrug	6E7R	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
10615	COc1cc(-c2cc(OCC3CC3)c(OCC3CCOCC3)cc2C)ccc1NC1CCN(C)C1	AlphaDrug	6E7R	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
10616	O=c1c2ccccc2n(-c2ccc(O)c(N3CCCC3)c2)n1C1CCCCC1	AlphaDrug	5UFS	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
10617	CC(NC(=O)CC1=CCCCC1)C(=O)Nc1cccc(-c2ccc(F)cc2)c1	AlphaDrug	5UFS	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
10618	O=C(Nc1ccccc1C(F)(F)F)c1cccc(NC2CCCc3ccc(O)cc32)c1	AlphaDrug	5UFS	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
10619	O=C(Nc1cc(Cl)ccc1C(F)(F)F)C1CCCc2ccc(O)cc21	AlphaDrug	5UFS	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
10620	O=C(c1cccc(F)c1NC1CCCc2ccc(O)cc21)N1CC=CCCC1	AlphaDrug	5UFS	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

10606 to 10620 of 73725 items. Total 4915 pages.