Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
10966	Cc1cc(OCc2cccc(C(F)(F)F)c2)ccc1-c1nc2ccc(F)cc2[nH]1	AlphaDrug	4Z2G	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
10967	Cc1cc(OCc2cccc(C(F)(F)F)c2)ccc1-c1ccc(CN2CCCCC2)c(Cl)c1	AlphaDrug	4Z2G	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
10968	Cc1cc(OCc2cccc(C(F)(F)F)c2)ccc1CN1CCN(C(=O)C2CCCCC2)CC1	AlphaDrug	4Z2G	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
10969	Cc1cc(OCc2cccc(C(F)(F)F)c2)ccc1-c1ccc2c(c1)CC(C(=O)NO)CCC(O)C2	AlphaDrug	4Z2G	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
10970	Cc1cc(OCc2cccc(C(F)F)c2)cc(-c2ccc(C3(C(=O)NCC4(C(=O)O)CCCC4)CC3)nc2)c1	AlphaDrug	4Z2G	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
10971	Cc1cc(OCc2cccc(C(F)(F)F)c2)ccc1-c1nc(C2(C(=O)NCC3(C(=O)O)CCCC3)CC2)cnc1C	AlphaDrug	4Z2G	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
10972	Cc1cc(OCc2cccc(C(F)(F)F)c2)cc2ncc(NC(=O)C3CCCCC3)cc12	AlphaDrug	4Z2G	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
10973	Cc1cc(OCc2cccc(C(F)(F)F)c2)cc2nc(N)ncc12	AlphaDrug	4Z2G	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
10974	Cc1cc(OCc2cccc(C3=CCCCC3)c2)cc2nccc(NS(=O)(=O)c3ccccc3)c12	AlphaDrug	4Z2G	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
10975	Cc1cc(OCc2cccc(C(F)(F)F)c2)ccc1-c1ccc2ccccc2c1	AlphaDrug	4Z2G	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
10976	Cc1cccc2c1Cc1cc3cc(c1)OCC(C/C=C\CCO3)CCCC(=O)N1CC(N)CCC1C2	AlphaDrug	4Z2G	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
10977	Cc1cc(OCc2cccc(C(=O)Nc3ccccn3)c2)cc2[nH]ccc12	AlphaDrug	4Z2G	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
10978	Cc1cc(OCc2cccc(C(F)(F)F)c2)ccc1-c1ccc2c(c1)CN(CC1CCCCC1)C(=O)C2	AlphaDrug	4Z2G	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
10979	Cc1cc(Oc2cccc3ccccc23)ccc1-c1ccc(CC(=O)O)c(Cl)c1	AlphaDrug	4Z2G	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
10980	Cc1cccc(CC2CCC(N)CN(C(=O)NC3CCCC3)C(=O)c3ccc(cc3)-c3cc(nc(C4CCCCC4)n3)C2)c1	AlphaDrug	4Z2G	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

10966 to 10980 of 73725 items. Total 4915 pages.