Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
11281	CC(C)CNC(=O)C(C=C1CCN(S(=O)(=O)c2ccc(C(C)C)cc2)CC1)NC(=O)c1ccccc1	AlphaDrug	5NYA	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
11282	CC(C)c1ccc(S(=O)(=O)N2CCC(NC(CCc3ccc(Cl)cc3)C(=O)NCC(C)(C)C)CC2)cc1	AlphaDrug	5NYA	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
11283	CC(C)c1ccc(S(=O)(=O)N2CCC(NC(=O)c3ccc(-c4ccc(C(=O)O)cc4)cc3)CC2)cc1	AlphaDrug	5NYA	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
11284	CC(C)c1ccc(S(=O)(=O)N2CCC(NC(=O)c3cccc(OC4CCCCCC4)c3)CC2)cc1	AlphaDrug	5NYA	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
11285	CC1=C(C)N(S(=O)(=O)c2ccc(C(C)C)cc2)CC/C(=C\C(=O)NCC(C)(C)C)C1	AlphaDrug	5NYA	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
11286	CC(C)c1ccc(S(=O)(=O)N2CCC(=Cc3ccc(C(N)=O)cc3)CC2)cc1	AlphaDrug	5NYA	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
11287	CC(NCc1ccccc1)c1ccc(-c2cccc(CNC(=O)COc3ccc(Cl)cc3)c2)cc1	AlphaDrug	5NZN	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
11288	CC(NC(=O)c1ccc(-c2ccc(-c3ccccc3)c(NS(=O)(=O)c3ccccc3C(F)(F)F)c2)s1)c1ccccc1	AlphaDrug	5NZN	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
11289	Cc1cc(C(C)NC(=O)c2ccc(-c3ccc(-c4ccccc4)c(NS(=O)(=O)c4ccccc4Cl)c3)s2)ccc1Cl	AlphaDrug	5NZN	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
11290	Cc1cc(C(C)NC(=O)c2ccc(-c3ccc(CN4CCC(C(=O)O)CC4)c(C)c3)s2)ccc1Cl	AlphaDrug	5NZN	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
11291	Cc1ccccc1-c1ccc(-c2ccc(C(=O)NC(C)c3ccc(Cl)c(Cl)c3)s2)oc1=O	AlphaDrug	5NZN	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
11292	Cc1cc(C(C)NC(=O)c2ccc(-c3ccc(-c4ccccc4)c(NS(C)(=O)=O)c3)s2)ccc1Cl	AlphaDrug	5NZN	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
11293	CC(NC(=O)c1ccc(-c2ccc(-c3ccccc3)c(NS(=O)(=O)c3ccccc3F)c2)s1)c1ccccc1	AlphaDrug	5NZN	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
11294	CC(=O)NCCCc1ccc(-c2ccc(CCC(=O)OC3CCCC3)c(C(N)=O)c2)cc1	AlphaDrug	5NZN	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
11295	CC(NC(=O)c1ccc(-c2ccc(-c3ccccc3)c(=O)[nH]2)s1)c1ccc(Cl)c(Cl)c1	AlphaDrug	5NZN	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

11281 to 11295 of 73725 items. Total 4915 pages.