Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
11731	NC(=O)CC(=O)Nc1cc2c(-c3ccc(F)cc3)cccc2c(NC(=O)C2CC2)c1O	AlphaDrug	6AJY	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
11732	NC(=O)CC(=O)Nc1cc2c(-c3cccc(NC(=O)C4CC4)c3)cc(Cl)cc2[nH]1	AlphaDrug	6AJY	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
11733	COc1cc(-c2ccccc2)cc(-c2cccc(-c3ccccc3)c2)c1	AlphaDrug	6J7E	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
11734	O=[N+]([O-])c1cc(N2CCC(=Cc3ccc(-c4ccccc4)cc3)CC2)ccn1	AlphaDrug	6J7E	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
11735	COc1cc(-c2cccc(-c3ccccc3)c2)cc2c1cc(C)n2C	AlphaDrug	6J7E	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
11736	COc1ccc(S(=O)(=O)N2CCC(=Cc3ccc(N4CCN(c5ccc(C(=O)N6CCCCC6)cc5)CC4)cc3)CC2)cc1	AlphaDrug	6J7E	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
11737	COc1cccc(-c2cc(OC)cc(S(=O)(=O)N3CCC(C(=O)NCC(=O)O)(c4ccccc4)CC3)c2)c1	AlphaDrug	6J7E	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
11738	CC(=O)Nc1ccc(-c2ccc(-c3cccc(-c4ccccc4)c3)cc2)cc1	AlphaDrug	6J7E	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
11739	CCc1ccc(O)c(C(=O)N(C)C)c1C(=O)Nc1cccc(-c2ccccc2)c1	AlphaDrug	6J7E	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
11740	COc1ccc(-c2ccc(N(C)CC(=O)c3ccc(C(=O)O)cc3)cc2)cc1	AlphaDrug	6J7E	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
11741	COc1cccc2c(-c3cccc(OCCC4(C(=O)N5CCCCC5)CC4)c3)c(C)n(C)c12	AlphaDrug	6J7E	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
11742	COc1ccccc1OCCN1CCN(c2ccc(C(=O)NC(CCC(=O)O)c3cccc(C(=O)O)c3)cc2)CC1	AlphaDrug	6J7E	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
11743	CC(C)Cc1cc(NC(=O)C(NC(=O)C2CCC(NS(=O)(=O)c3ccc(Cl)cc3)C2)c2cccc(Cl)c2)cc(C(F)(F)F)c1	AlphaDrug	5DBM	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
11744	CC(C)CC1=C(C(F)(F)F)/C=C\C(NC(=O)C(N)Cc2ccc(OC(C)C(=O)O)c(O)c2)C(=O)N/C(c2cccc(OCC(=O)O)c2)=C\1	AlphaDrug	5DBM	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
11745	COc1ccc(CC(N)C(=O)NC(C(=O)Nc2ccc(C(N)=O)c(CC(C)C)c2)c2cccc(C)c2)cc1	AlphaDrug	5DBM	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

11731 to 11745 of 73725 items. Total 4915 pages.