Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
14701	CC(=O)N1CCC2(CCCC2)CC1C(=O)Nc1cc(-c2ccc3ccccc3c2)ccc1Cc1ccccc1	AlphaDrug	4O97	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14702	CC(C)(C)CC(NC(=O)C(CCc1ccccc1)NC(=O)C1CCCN1C(=O)c1ccc(C2CC2)cc1)C(=O)NCc1ccccc1	AlphaDrug	4O97	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14703	CC(C)(C)CC(NC(=O)C(CC(=O)O)NC(=O)C(Cc1ccccc1)NC(=O)c1cc(Cl)cc(C2CC2)c1)C(=O)NCc1ccccc1	AlphaDrug	4O97	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14704	Cc1ccc(CC2CCCCC2)cc1C(=O)NC(Cc1ccccc1)C(=O)NC(CC(=O)O)C(=O)NC(CC(C)(C)C)C(=O)NC1CCCCCN(C)C1=O	AlphaDrug	4O97	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14705	CCN(CC)C(=O)c1ccc(-c2cccc(-c3ccc(CCC4(C(=O)O)CCOCC4)cc3)c2)cc1	AlphaDrug	5L9O	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14706	CCN(CC)C(=O)c1ccc(-c2cccc(-c3ccc(CCc4ccc(C(=O)O)cc4)cc3)c2)cc1	AlphaDrug	5L9O	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14707	CCN(CC)C(=O)c1ccc(-c2cccc(-c3cccc(CO)c3)c2)cc1	AlphaDrug	5L9O	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14708	CCN(CC)C(=O)c1ccc(-c2cccc(-c3ccc(CCc4ccc(C(=O)O)c(OC)c4)cc3)c2)cc1	AlphaDrug	5L9O	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14709	CCN(CC)C(=O)c1cc(C(=O)O)cc(-c2ccc(C(=O)NC3C(O)CCC(C)C3c3ccc(F)cc3)cc2C(F)(F)F)c1	AlphaDrug	5L9O	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14710	CCN(CC)C(=O)c1ccc(-c2cccc(-c3cccc(CCC(=O)O)c3)c2)cc1	AlphaDrug	5L9O	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14711	CCN(CC)C(=O)c1cccc(-c2ccc(CCOc3ccc(-c4cccc(C(=O)O)c4)cc3)cc2)c1	AlphaDrug	5L9O	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14712	CCN(CC)C(=O)c1ccc(-c2cccc(-c3cccc(-c4ccc(CC(=O)O)cc4)c3)c2)cc1	AlphaDrug	5L9O	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14713	CCN(CC)C(=O)c1ccc(-c2cccc(-c3ccc(CCCCCC(=O)O)cc3)c2)cc1	AlphaDrug	5L9O	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14714	CCN(CC)C(=O)c1ccc(-c2cccc(-c3ccc(CCc4cc(OC)ccc4OC)cc3)c2)cc1	AlphaDrug	5L9O	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14715	CC(=O)N1CCC(Oc2ccc(C(=O)Nc3ccc(Cl)cc3)cc2)CC1	AlphaDrug	5J3L	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

14701 to 14715 of 73725 items. Total 4915 pages.