Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
14656	COc1ccc(-c2cccc(C(=O)O)c2)cc1NC(=O)c1cccc(OCc2ccccc2)c1	AlphaDrug	5OM3	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14657	COc1ccc(-c2cccc(C(F)(F)F)c2)cc1NC(=O)c1cccc(N2CCC(C(=O)O)CC2)c1	AlphaDrug	5OM3	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14658	COc1ccc(N2CCC(C3CC3)CC2)cc1NC(=O)c1ccc(OCc2cccc(C(F)(F)F)c2)cc1	AlphaDrug	5OM3	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14659	COc1ccc(-c2ccc(F)cc2)cc1NC(=O)c1ccc(OC)c(C(=O)O)c1	AlphaDrug	5OM3	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14660	COc1ccc(-c2cccc(C(F)(F)F)c2)cc1NC(=O)c1cccc(OCC(=O)NC(CO)C(C)C)c1	AlphaDrug	5OM3	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14661	COc1ccc(-c2cccc(C(F)(F)F)c2)cc1NC(=O)c1ccc(OCc2cccc(C(F)(F)F)c2)cc1	AlphaDrug	5OM3	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14662	COc1ccc(-c2cccc(C(F)(F)F)c2)cc1NC(=O)c1ccc(OCC2CCCCC2)cc1	AlphaDrug	5OM3	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14663	COc1ccc(-c2cccc(C(C)C)c2)cc1NC(=O)c1ccc(OCc2cccc(C(F)(F)F)c2)cc1	AlphaDrug	5OM3	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14664	COc1ccc(-c2cccc(C(F)(F)F)c2)cc1NC(=O)c1ccc(OCc2cccc(C(=O)O)c2)cc1	AlphaDrug	5OM3	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14665	Cc1nc(Nc2ccc(S(N)(=O)=O)cc2)nc(-c2ccc(-c3ccc(-c4cccc(N)c4)cc3)cc2)n1	AlphaDrug	6FTF	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14666	Cc1nc(Nc2ccc(S(N)(=O)=O)cc2)nc(-c2ccc(-c3ccc(-c4ccccc4)cc3)cc2)n1	AlphaDrug	6FTF	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14667	Cc1nc(Nc2ccc(S(N)(=O)=O)cc2)nc2c(Nc3ccc(N4CCOCC4)cc3)nccc12	AlphaDrug	6FTF	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14668	Cc1nc(Nc2ccc(S(N)(=O)=O)cc2)nc(-c2ccc(-c3ccc(-c4cccnn4)cc3)cc2)n1	AlphaDrug	6FTF	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14669	Cc1nc(Nc2ccc(S(N)(=O)=O)cc2)nc(-c2ccc(N3CC(O)CC3C(C)CO)cc2)n1	AlphaDrug	6FTF	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14670	Cc1nc(Nc2ccc(S(N)(=O)=O)cc2)nc(-c2cccc(-c3ccc(-c4ccccc4)cc3)c2)n1	AlphaDrug	6FTF	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

14656 to 14670 of 73725 items. Total 4915 pages.