Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
14611	CC(C)(C)c1cnc(N)n2nc(-c3cc(O)ccc3O)cc12	AlphaDrug	5MWP	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14612	Nc1cc(-c2ccc(F)c(N3CCC(O)C3)c2)c(C(=O)NCCCCN2CCC(C(=O)O)CC2)c(O)c1O	AlphaDrug	5MWP	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14613	CC(C)(C)c1cnc(CC(=O)N2CCNC2)c(NC(=O)c2ccc(-c3ccc4ccccc4n3)cc2)n1	AlphaDrug	5MWP	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14614	CC(C)(C)c1cnc(N)c(Sc2cccc(C(=O)N3CCOC3)c2)c1	AlphaDrug	5MWP	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14615	COc1ccc(-c2cc(C(F)(F)C(=O)NC3CCCCCN3)sc2-c2ccc(C(=O)NO)cc2)cc1	AlphaDrug	4RE4	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14616	COc1ccc(-c2cc(C(F)(F)C(=O)NC3CCCCC3O)sc2-c2ccc(C(=O)NO)cc2)cc1	AlphaDrug	4RE4	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14617	COc1ccc(-c2cc(C(=O)NCC3CCCC3O)sc2-c2ccccc2)cc1	AlphaDrug	4RE4	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14618	COc1ccc(-c2cc(C(F)(F)C(=O)NCC3CCCC(F)(F)C3)sc2-c2ccc(C(=O)NO)cc2)cc1	AlphaDrug	4RE4	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14619	COc1ccc(-c2cc(C(=O)NC(C)C)sc2-c2ccc(C(=O)NCC3CCC(C(=O)O)O3)cc2)cc1	AlphaDrug	4RE4	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14620	COc1ccc(-c2sc(OC3CCN(C(=O)C(c4ccc(-c5ccccc5)cc4)C4CC4)CC3)nc2C)cc1	AlphaDrug	4RE4	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14621	COc1ccc(-c2cc(C(F)(F)F)sc2-c2ccc(C(=O)NO)cc2)cc1	AlphaDrug	4RE4	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14622	COc1ccc(-c2cc(C(C)(C)C)sc2C(=O)NC(Cc2ccc(-c3ccccc3OC)cc2)C(=O)NCC(=O)O)cc1	AlphaDrug	4RE4	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14623	COc1ccc(-c2cc(C(F)(F)C(=O)NCC3CCCCC3O)sc2-c2ccc(C(=O)NO)cc2)cc1	AlphaDrug	4RE4	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14624	COc1ccc(-c2coc3nc(-c4ccc(-c5ccc(C(=O)O)cc5)cc4)cc(/C=C/CNC(=O)OC(C)(C)C)c23)cc1	AlphaDrug	4RE4	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14625	CC(C)Cc1cc(C(N)=O)cc(S(=O)(=O)c2cccc3ccccc23)c1	AlphaDrug	4TQN	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

14611 to 14625 of 73725 items. Total 4915 pages.