Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
15016	COc1cccc(Cc2nc3ccccc3n2Cc2ccc(C(=O)O)cc2)c1	AlphaDrug	6JB0	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
15017	COc1cccc(Cc2nc3ccccc3n2C)c1	AlphaDrug	6JB0	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
15018	COc1cccc(Cn2nc(C(=O)O)nc2-c2ccccc2)c1	AlphaDrug	6JB0	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
15019	COc1cccc(Cc2nc3ccc(Cl)cc3n2Cc2ccc(O)cc2)c1	AlphaDrug	6JB0	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
15020	CC12OC(CC1(O)CO)n1c3ccccc3c3c4c(c5c6ccccc6n2c5c31)C=NC4=O	AlphaDrug	4UFH	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
15021	COc1cc(F)cc(S(=O)(=O)N2CCC(N(CCO)c3ccc(C(N)=O)cc3)CC2)c1	AlphaDrug	4UFH	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
15022	O=C(NCC1CCN(c2ccc(-c3cccc(C(F)(F)F)c3)cc2)CC1)c1ccc(F)cc1	AlphaDrug	4UFH	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
15023	COc1cc(-c2ccc3c(c2)C(C)=C3C(=O)NCCCCCCC(N)=O)cc(F)c1C	AlphaDrug	4UFH	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
15024	COc1cc(C2CCC(N(CC3CCCCC3)c3ccc(F)c(Cl)c3)CC(=O)NC2=O)cc(F)c1Cl	AlphaDrug	4UFH	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
15025	COc1ccc(C(=O)NC(C)(C)C)c(-c2ccc(F)c(C(=O)O)c2)c1	AlphaDrug	4UFH	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
15026	COc1cc(C2CCCNC(=O)CC(NC(=O)NC(=O)C3(c4ccc(Cl)c(Cl)c4)CC3)CC2)cc(Cl)c1Cl	AlphaDrug	4UFH	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
15027	COc1cc(C(=O)NC2CCCCC2)cc(F)c1CC1CCN(c2ccc(C(C)(C)C)cc2)CC1	AlphaDrug	4UFH	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
15028	COc1cc(-c2nc(NC(=O)c3ccc(Cl)cc3)ccc2Cl)cc(F)c1C(=O)N(C)C	AlphaDrug	4UFH	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
15029	COc1ccc(C2CCC(Oc3ccc(C(=O)Nc4nc5ccccc5s4)cc3)CC2)cc1	AlphaDrug	4UFH	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
15030	CCc1cc(NC(=O)C(Cc2ccc(C(=O)NS(=O)(=O)C3CCC(c4cccc(OC)c4)CC3)cc2)c2ccccc2)cc(C(=O)O)c1O	AlphaDrug	5MPZ	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

15016 to 15030 of 73725 items. Total 4915 pages.