Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
14971	Cc1ccc(-c2ccc(-c3cc4cc(C(F)(F)F)ccc4cc3F)cc2C(=O)N2CCC(C(=O)O)CC2)cc1	AlphaDrug	5DW2	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14972	COc1cccc(-c2cc(C(F)(F)C(F)(F)F)cnc2-c2ccc(C(=O)O)cc2)c1	AlphaDrug	5DW2	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14973	Cc1cc(C(F)(F)F)cc2nn(-c3cc(-c4c(C(F)(F)F)cccc4C(F)(F)F)ccc3Cc3ccc(C(=O)O)cc3)cc12	AlphaDrug	5DW2	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14974	Cc1cc(C(=O)NC2CCN(C(=O)N3CCN(C)CC3)CC2)cc2nn(-c3cc(C(F)(F)F)ccc3C(F)(F)F)cc12	AlphaDrug	5DW2	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14975	Cc1cc(-c2ccc(C(=O)O)cc2)cc2nn(-c3cc(-c4ccccc4)n[nH]3)cc12	AlphaDrug	5DW2	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14976	Cc1cc(-c2cc(F)ccc2F)cc2nn(-c3cc(-c4cnn(C)c4)ccc3Cc3ccccc3)cc12	AlphaDrug	5DW2	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14977	Cc1ccc(F)cc1-c1cc(C)c2cn(-c3cc(-c4cnn(C)c4)ccc3Cc3ccccc3)nc2c1	AlphaDrug	5DW2	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14978	Cc1ccc(C)c(-c2cc(C)c3cn(-c4cc(-c5cnn(C)c5)ccc4Cc4ccccc4)nc3c2)c1	AlphaDrug	5DW2	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14979	Cc1cc(C(F)(F)F)cc2nn(-c3cc(-c4c(C(F)(F)F)cnc5ccccc45)ccc3C(=O)O)cc12	AlphaDrug	5DW2	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14980	Cc1cc(NC(=O)c2cccc(OC3=CC(NC(=O)c4ccc(-n5cnc(C)n5)cc4)=C3)c2)nc(C)n1	AlphaDrug	5FHN	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14981	Cc1cc(NC(=O)c2cccc(OC3=CC(NC(=O)c4ccc(-c5cnccn5)cc4)=C3)c2)cc(C)c1O	AlphaDrug	5FHN	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14982	Cc1cc(NC(=O)c2cccc(OC3=CC(NC(=O)c4ccc(-c5cnccn5)cc4)=C3)c2)cc(O)c1O	AlphaDrug	5FHN	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14983	Cc1cc(NC(=O)c2cccc(OC3=CC(NC(=O)c4ccc(-n5cnc(C(=O)O)c5)cc4)=C3)c2)cc(C(=O)O)c1	AlphaDrug	5FHN	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14984	Cc1cc(NC(=O)c2cccc(OC3=CC(NC(=O)c4ccc(-c5cnco5)cc4)=C3)c2)cc(OCCN2CCOCC2)c1C	AlphaDrug	5FHN	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14985	Cc1cc(NC(=O)c2cccc(OC3=CC(NC(=O)c4ccc(-c5cc(N)ncn5)cc4)=C3)c2)cc(C(=O)O)c1	AlphaDrug	5FHN	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

14971 to 14985 of 73725 items. Total 4915 pages.