Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
20221	CS(=O)(=O)c1ccc(CCC(=O)NCc2cccc(-c3ccc(N)nc3)c2)cc1	AlphaDrug	5UPF	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
20222	CS(=O)(=O)Nc1ccc(-c2ccc3c(c2)CC(CCC(=O)NCc2ccc4ccccc4c2)C3)cc1	AlphaDrug	5UPF	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
20223	CS(=O)(=O)Nc1ccc(-c2ccc3c(c2)CCC(CCC(=O)NCc2ncc[nH]2)C3)cc1	AlphaDrug	5UPF	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
20224	CS(=O)(=O)Nc1ccc(C(=O)NCc2ccccc2)c(Cl)c1	AlphaDrug	5UPF	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
20225	CS(=O)(=O)Nc1ccc(-c2ccc3c(c2)CC(CCC(=O)NCc2ccc4[nH]cnc4c2)C3)cc1	AlphaDrug	5UPF	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
20226	CC(C)Cc1cccc(NS(C)(=O)=O)c1NC(=O)NC(Cc1c[nH]c2ccccc12)C(=O)NCc1cccc2cccnc12	AlphaDrug	5UPF	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
20227	CS(=O)(=O)Nc1ccc(-c2ccc3c(c2)CC(CCC(=O)NCc2ccc4ccccc4c2)C3)cc1	AlphaDrug	5UPF	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
20228	CS(=O)(=O)Nc1ccc(-c2ccc(CNC(=O)c3ccc(C(F)(F)F)cc3)c(C(F)(F)F)c2)cc1	AlphaDrug	5UPF	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
20229	CS(=O)(=O)Nc1ccc(-c2ccc3c(c2)C(=O)NC(CCC2CC2)C3)cc1	AlphaDrug	5UPF	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
20230	CS(=O)(=O)Nc1ccccc1CC1CCN(C(=O)c2ccc(C3(NC(=O)c4ccc(F)cc4)CC=CCC3)cn2)CC1	AlphaDrug	5UPF	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
20231	Cc1cc(Nc2nc(N3CCN(C(=O)NC(C)(C)C)CC3)nc3ccccc23)nc(-c2ccc3ccccc3n2)n1	AlphaDrug	6I8M	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
20232	Cc1cc(Nc2nc(N3CCN(C(=O)NC(C)(C)C)CC3)nc3ccccc23)nc(-c2ccc3ccccc3c2)n1	AlphaDrug	6I8M	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
20233	Cc1ccc(NC(=O)c2cccc(C(F)(F)F)c2)cc1-c1cnn(-c2ccc(N3CCNCC3)cc2)c1	AlphaDrug	6I8M	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
20234	Cc1cc(Nc2nc(N3CCN(C(=O)C4CCCC4)CC3)nc3ccccc23)nnc1-c1cnn(CC(=O)NC2CC2)c1	AlphaDrug	6I8M	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
20235	Cc1cc(Nc2nc(N3CCN(C(=O)NC(C)(C)C)CC3)nc3ccccc23)nnc1-c1ccncc1	AlphaDrug	6I8M	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

20221 to 20235 of 73725 items. Total 4915 pages.