Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
20236	Cc1cc(Nc2nc(N3CCN(C(=O)NCCCO)CC3)nc3ccccc23)ncc1-c1cnn(CCN2CCOCC2)c1	AlphaDrug	6I8M	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
20237	Cc1cc(Nc2nc(N3CCN(C(=O)NC(C)(C)C)CC3)nc3ccccc23)nc(-c2cccc3ccccc23)n1	AlphaDrug	6I8M	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
20238	Cc1cc(Nc2nc(N3CCN(C(=O)NC(C)(C)C)CC3)nc3ccccc23)nn2nc(N3CCN(C(=O)NC4CC4)CC3)nc12	AlphaDrug	6I8M	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
20239	Cc1ccc(-c2n[nH]c3c(C(N)=O)cccc23)cc1	AlphaDrug	6I8M	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
20240	Cc1cc(Nc2nc(N3CCNCC3)nc3ccccc23)cc(N2CCN(C3CC3)CC2)n1	AlphaDrug	6I8M	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
20241	Cc1ccc(C(=O)C(CC(C)C)NC(=O)C(Cc2ccccc2)NC(=O)c2ccc3c(C(F)(F)F)cccc3c2)cc1C	AlphaDrug	6N7A	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
20242	CC(C)CC(NC(=O)C(Cc1ccccc1)NC(=O)c1cccc2ccccc12)C(=O)NC(C(=O)O)C(=O)NCCc1ccccc1	AlphaDrug	6N7A	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
20243	CC(C)NC(=O)CC(NC(=O)C(NC(=O)N(CC(=O)NC(CC(=O)O)C(=O)O)CC(O)CC(C)(C)C)C(C)C)C(=O)OCC(=O)O	AlphaDrug	6N7A	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
20244	CC(C)CC(NC(=O)C(Cc1ccccc1)NC(=O)c1ccc2c(O)cccc2n1)C(=O)O	AlphaDrug	6N7A	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
20245	CC(C)CC(NC(=O)C(O)CNC(=O)C(C)NC(=O)OC(C)(C)C)C(=O)CCC(N)=O	AlphaDrug	6N7A	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
20246	CC(C)CC(NC(=O)C(Cc1ccccc1)NC(=O)c1ccc2c(O)cccc2n1)C(=O)NC(CC(=O)O)C(=O)NCC(=O)O	AlphaDrug	6N7A	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
20247	CC(C)CC(NC(=O)C(Cc1ccccc1)NC(=O)c1ccc2c(C(F)(F)F)cccc2c1)C(=O)c1ccccn1	AlphaDrug	6N7A	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
20248	CC(C)CC(Nc1ccc(CC2CC(c3ccccc3)N2)cc1)C(=O)O	AlphaDrug	6N7A	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
20249	CC(C)CC(NC(=O)C(Cc1ccccc1)NC(=O)c1cc(-c2ccncc2)c(Cl)cc1F)C(=O)O	AlphaDrug	6N7A	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
20250	CC(C)CC(NC(=O)C(Cc1ccccc1)NC(=O)c1cc(N(C)C)ccc1F)C(=O)c1ccccc1	AlphaDrug	6N7A	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

20236 to 20250 of 73725 items. Total 4915 pages.