Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
66151	CCC(O)CC1=C(C)CC2=CC3C4C(=C21)C(O)C(CC)C(=O)N4CCC3(F)F	TargetDiff	5DX4	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
66152	CC1CCC(C)C2CC(C(C)(C)F)C(O)C(C)(C)C2C1	TargetDiff	5DX4	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
66153	ON1CCNC(CN2NNc3ccccc32)C1	TargetDiff	5DX4	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
66154	O=C1Nc2nc3ccc(F)cc3nc2C2C=CC=CC=C12	TargetDiff	5DX4	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
66155	FC1N2C=CNC(=S)C2=NCC1(F)F	TargetDiff	5DX4	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
66156	CCCN1C2=C(C(=O)O)C(C(=O)O)CC2c2cc(C(=O)O)ccc21	TargetDiff	5DX4	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
66157	NC(=O)C1=C(C(=O)O)OC(C(=O)O)C1	TargetDiff	5DX4	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
66158	CCC1CCC2C(CCCC3(C)C2C=CC2C(C)CCC(C)CC(C)C23)C1C	TargetDiff	5DX4	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
66159	N=C(NN)C1=CC(O)=C(N=C2NNC(=N)[C@@H]2c2ccccc2)C=CC1	TargetDiff	5ZA7	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
66160	CC(=O)[C@H](C)CCN(CO)c1cnc2cc(N=C(N)N)ccc2n1	TargetDiff	5ZA7	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
66161	N=C1N=CC2=CC=C3CC4C(C(=O)O)C=CN(O)C4CC4CCCCC4OC3C2=N1	TargetDiff	5ZA7	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
66162	CNCC(=N)[C@H]1C[C@H]2C[C@@H]3C(=C2O1)C(=N)OC=C1CC(=CCN)C[C@@H]13	TargetDiff	5ZA7	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
66163	CCC(=O)C1=C2OC3C4C=CC=C(CO)C4OCC3C(O)C2N2CCC(CC3=CCC(=N)N=C3)C2=N1	TargetDiff	5ZA7	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✖	✔	✔	✖	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
66164	CC(=O)C1(C)C=C2C=C(C(=N)NN)C=CC2c2cc3c(cc21)C(CC(=O)O)OC3=O	TargetDiff	5ZA7	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
66165	CC(CO)C1CCC(C(CCN2C(=O)[C]=C(C(=N)NC#N)COC2C)c2cccnn2)C1	TargetDiff	5ZA7	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

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