Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
66226	O=P(O)(O)C1OC(O)C(C2CN3C=NCNC4=C3N2CCN4)CC1O	TargetDiff	6MKU	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔
66227	CC1=NC(=N)/C2=C/C=C(/CCC(=O)O)C3CC(C(O)C(O)O)C(C)C3CC2=N1	TargetDiff	6MKU	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✖	✔	✔	✖	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔
66228	OCC(O)C(O)C(O)(CO)C1(O)CC(O)(O)CC1O	TargetDiff	6AOX	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
66229	O=C(O)C(O)C(O)C(O)C(O)CO	TargetDiff	6AOX	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
66230	O=C(O)C(=O)O	TargetDiff	6AOX	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
66231	O=C(O)CCO	TargetDiff	6AOX	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
66232	CC(O)(O)C(O)CO	TargetDiff	6AOX	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
66233	O=C(O)C1OC(O)C(O)C1O	TargetDiff	6AOX	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
66234	CC(O)CC(O)C(O)C(C)C(O)C(O)CO	TargetDiff	6AOX	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
66235	O=C(O)S(O)(O)O	TargetDiff	6AOX	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
66236	NC(C(O)CO)C(O)C(=O)O	TargetDiff	6AOX	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
66237	CCC12OCCCCC1C(O)C(O)C(C(O)C(=O)CC(=O)O)O2	TargetDiff	6AOX	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
66238	CC=C[C@@](O)(C1C=CCC=C1)[C@@H](Cc1ccc(F)cc1)C1CCC(OC(F)(F)C(F)(F)F)C1	TargetDiff	6C7X	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
66239	CC(C)C(=O)NC(C(=O)CC(F)(F)C(O)S(O)(O)O)C1C=CC=C(C(=N)N)C=C1	TargetDiff	6C7X	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
66240	C=C(O)CCC(CO)OC(CCCCCC1CCC(C)C1CCC=C=CC)NC(=O)COC(C)CCC(F)(F)C(F)(F)F	TargetDiff	6C7X	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

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