Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
67096	CCCC(C)C1OC(OC(C)=O)C2COC(CCCC(C(=O)O)S(O)(O)O)C(C(=O)OC3CCCC(C)CC3)C2C1C(=O)O	TargetDiff	6OE1	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
67097	CC1C(O)C(O)(O)CC2CCC3C2C2(C(=O)CC(O)(CO)C12)N3C(=O)c1cccc(F)c1	TargetDiff	6OE1	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
67098	CC(=O)N1OC(C(O)CC(C)O)C(O)CC(C(=O)O)C(O)C2=C1CCC2C(N)=O	TargetDiff	6OE1	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
67099	COC1OCC2=CCC(O)=CC2C(O)CN2C3=C(CC(F)=C3C(F)(F)F)N(C1C)C2(O)OC	TargetDiff	6OE1	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
67100	NC(=O)c1ccccc1C(=O)C1C(F)=CNC=C2C(=O)N(O)c3cnccc3C21	TargetDiff	6OE1	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
67101	COCC(C)C(OC1C(O)C(CC(C)C(C)C(=O)O)N(C(N)=O)C(C)C1(O)O)C(C)(C)OC	TargetDiff	6OE1	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
67102	CC12C(O)CC(C3CCC4OC(=O)C(CCOC(=O)C(O)C(O)C5OC(C3)C(CCO)C(P(O)O)C5(O)O)OC41)C2O	TargetDiff	6OE1	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✖	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
67103	[O]S([O])(NO)C1C(O)=CC(C(O)=C=C2C=CCC=C(O)C2c2ccccc2)=C(O)C1O	TargetDiff	6OE1	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
67104	CCC1C=CC2C3=C(C4=C(C(N)C3=C1)C([SH](O)(O)(O)O)CC4)N(C)NC2C1C=CCC=C1C	TargetDiff	6OE1	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
67105	CC(O)CCC(=O)C1C2=CCC=CC2=C=C2C(O)=CC(C(O)(F)F)=C(C=O)C2N2COCC=C12	TargetDiff	6OE1	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
67106	CC[C@H]1[C@H]2[C@H]3COc4cccc(c4)CC4C=CC=C5OC(=O)[C@H](C[C@@H]54)N1[C@@H]1C[C@@H](CN=C(N)N)CC[C@@]1(O)O[C@H]2C3	TargetDiff	5ZC5	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
67107	Cc1ccc([C@@](O)(CCC(=O)O)N2CC3=C4C(=CC[C@H]5C(=N)C=NCC[C@H]45)C=N[C@H]3N2C2=N[C@@H](C)C(=CO)C2)cc1	TargetDiff	5ZC5	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
67108	CC(C)N1C(=O)C(CC2CCC3=C2CC(C=N)N3)c2cc(C(=O)O)ccc21	TargetDiff	5ZC5	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
67109	N=C(N)C1CC2=C(CC=C(NC3=CCC=CC3)CC2)C1=N.O=C(CCCC1CCOC1=O)OC1C=CCC=C1.O=[P](O)O	TargetDiff	5ZC5	✖	✔	✔	✔	✔	✖	✖	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔
67110	C[C@@H](O)C(=C=O)C1=C=C(C(C)(C)O)CCCOC2C=CCC=C2[C@@H]2NC(=CC=CC#N)C(C/C=[C]/1)O2.N=CN	TargetDiff	5ZC5	✖	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✖	✖	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

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