Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
68506	N=C1CC(=O)N(C2C(=O)OC(O)(CO)CC2O[P](=O)OP(=O)(O)O)C=N1.O	TargetDiff	6BS4	✖	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✖	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
68507	COC1=C2NC(=O)N(C(=O)CC(O)COCOCP(=O)(O)OP(=O)(O)OP([O])[O])N2CN1	TargetDiff	6BS4	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
68508	N=C1CC(=N)N(C(=N)C(O)C(O)C(OP([O])[O])OP(O)C(COP(=O)(O)O)[P](=O)O)C=N1	TargetDiff	6BS4	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✖	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
68509	O=C(O)CC1OC(CO)C(OC(O)CC(O)C(O)P(O)(O)(O)O)O1	TargetDiff	6BS4	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
68510	NCc1cncc(O)c1.[O]P([O])O[P](=O)O[P](=O)OCCC(O)P(=O)(O)c1cccc(NC(=O)c2cccnc2)c1	TargetDiff	6BS4	✖	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
68511	CCCC(CN1C=CN=C(C)C=C1OC)C(C(=O)OP([O])[O])C(O)C(O)(CCC(=O)O[P](=O)OP([O])[O])OC	TargetDiff	6BS4	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
68512	Cc1ncc(N=C(NC[C@H](O)CO)C2C=CCC=N2)nn1.[O]P([O])OP(=O)(O)O	TargetDiff	6BS4	✖	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
68513	CCC(CC)CNC1=NN2C(=NC3=CC4=C(CC(=O)N4)C(CC)C32)C=N1	TargetDiff	5CAQ	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
68514	CC(C)C1=C2C=C3C4=C(CC(=N)N=C4C2NN1)N1CCCC31	TargetDiff	5CAQ	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
68515	CC(O)(O)C1C=NC=CC1C1C=CC(C(=O)C2C=CCC=C2)=C2NC(=O)CC2=C1	TargetDiff	5CAQ	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
68516	CCC1C(=O)NC(=O)C=C1NC(=O)NC	TargetDiff	5CAQ	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
68517	N=CN1CC(C2C=CC=NC2CO)c2cc3c(cc21)c(=O)nc1n3CCCCC1	TargetDiff	5CAQ	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
68518	Oc1ccc2c(c1)N1C(C3C=CCC=C3)N3C4CCCC4C4=CN(CC=N4)CC2C13	TargetDiff	5CAQ	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
68519	CN(CCO)C(=O)N=C1NCC=C2[C@H]1C1=C(CN)CCN21	TargetDiff	5CAQ	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
68520	CC1CC2=NCC=C3C2=C2C(=NC=CC2c2cc(O)ccc23)N1	TargetDiff	5CAQ	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

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