Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
14836	O=S(=O)(Cc1ccc(-c2cc(C3CCCCCC3)cc(C3CC3)c2)cc1)c1ccccc1	AlphaDrug	3G51	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14837	Cc1cc(O)cc(C(=O)Nc2cccc(-c3n[nH]c4ccccc34)c2)c1	AlphaDrug	3G51	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14838	Cc1cc(O)cc(-c2cc(O)c(Cc3c(F)cc(C(F)(F)F)cc3F)c(F)c2)c1	AlphaDrug	3G51	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14839	Cc1cc(O)cc(C(=O)Nc2cccc(-c3cccc(C4CCN(C(=O)CO)CC4)n3)c2)c1	AlphaDrug	3G51	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14840	Cc1cc(O)cc(C(=O)Nc2cc(-c3cccc(NS(=O)(=O)c4ccccc4)c3)[nH]n2)c1	AlphaDrug	3G51	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14841	Cc1cc(O)cc(C(=O)Nc2cccc(-c3cccc4c3CCCN(C3CCN(C(=O)C5CC5)CC3)C4)c2)c1	AlphaDrug	3G51	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14842	COc1cc(-c2cc(NC(=O)NC3CCC(C(=O)O)C3)c3ccccc3n2)cc(C)c1OC	AlphaDrug	3G51	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14843	Cc1cc(O)cc(-c2[nH]c3ccccc3c2C(=O)N(C)C2CCCCC2)c1	AlphaDrug	3G51	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14844	Cc1cc(O)cc(C(=O)Nc2cccc(-c3cccc(S(N)(=O)=O)c3)c2)c1	AlphaDrug	3G51	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14845	Cc1cc(O)cc(C(=O)Nc2cccc(-c3cccc(NC4CCCC4)c3)c2)c1	AlphaDrug	3G51	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14846	Cc1cc(O)cc(C(=O)Nc2cc(Cl)cc(-c3cccc(NS(=O)(=O)c4ccccc4)c3)c2O)c1	AlphaDrug	3G51	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14847	Cc1cc(O)cc(C(=O)Nc2cc(OCC3CCCCC3)cc(C3CCCCC3)c2)c1	AlphaDrug	3G51	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14848	Cc1cc(O)cc(C(=O)Nc2cccc(-c3ccc(C4CCN(S(=O)(=O)CC5CC5)C4)cc3)c2)c1	AlphaDrug	3G51	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14849	Cc1cc(O)cc(C(=O)Nc2cccc(-c3cccc(N4CCCC4)n3)c2)c1	AlphaDrug	3G51	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14850	Cc1cc(O)cc(C(=O)Nc2cccc(-c3cccc4ncccc34)c2)c1	AlphaDrug	3G51	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

14836 to 14850 of 73725 items. Total 4915 pages.