Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
14866	Cc1cc(O)cc(C(=O)Nc2cc(F)cc(-c3nc(C4CCN(C(=O)CO)CC4)cs3)c2O)c1	AlphaDrug	3G51	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14867	Cc1cc(O)cc(C(=O)Nc2cccc(-c3cccc(NS(=O)(=O)c4ccccn4)c3)c2)c1	AlphaDrug	3G51	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14868	Cc1cc(O)cc(C(C)(C)Nc2cccc(-c3cccc(NC4CC4)c3)c2)c1	AlphaDrug	3G51	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14869	O=C(N1CCOCC1)N1CCC(c2cc(-c3ccc(CS(=O)(=O)c4ccccn4)cc3)cc(C3CC3)c2)CC1	AlphaDrug	3G51	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14870	Cc1cc(O)cc(-c2cc(Oc3ccccc3)c(F)c(C)c2O)c1	AlphaDrug	3G51	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14871	Cc1cc(O)cc(C(=O)Nc2cccc(-c3cc(NC(=O)C4CC4)ccc3F)c2)c1	AlphaDrug	3G51	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14872	Cc1cc(O)cc(C(=O)Nc2cc(SCC3CCCC3)cc(C3CCCCC3)c2)c1	AlphaDrug	3G51	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14873	Cc1cc(O)cc(C(=O)Nc2cccc(-c3ccc(N4CCN(C(=O)CO)CC4)nc3)c2)c1	AlphaDrug	3G51	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14874	Cc1cc(O)cc(C(=O)Nc2cccc(-c3cccc(C(F)(F)F)c3)c2)c1	AlphaDrug	3G51	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14875	Cc1cc(O)cc(C(=O)Nc2cccc(-c3cccc4c3CCN(C3CCN(C(=O)C5CC5)CC3)C4)c2)c1	AlphaDrug	3G51	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14876	Cc1cc(O)cc(C(=O)Nc2cc(Cl)cc(-c3ccc(S(N)(=O)=O)cc3)c2O)c1	AlphaDrug	3G51	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14877	Cc1cc(O)cc(C(=O)Nc2cccc(-c3cccc(NC(=O)Nc4ccccc4)c3)c2)c1	AlphaDrug	3G51	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14878	Cc1cc(O)cc(C(=O)Nc2cccc(-c3cccc(NCc4n[nH]nc4O)c3)c2)c1	AlphaDrug	3G51	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14879	Cc1cc(O)cc(C(=O)Nc2cccc(-c3ccc(-c4ccccc4)nc3)c2)c1	AlphaDrug	3G51	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14880	Cc1cc(NC(=O)C(C)C)ncc1C(O)c1cc(-c2nc(C(F)(F)F)cc3ccccc23)ccc1O	AlphaDrug	5G45	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

14866 to 14880 of 73725 items. Total 4915 pages.