Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
14896	CC(C)CC1CCC(n2c(-c3ccc(C(=O)O)cc3)nc3cc(-c4ccc(Cl)cc4)ccc32)C1	AlphaDrug	5L2S	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14897	Cc1ccc(-c2nc3cc(-c4nnnn4C)cnc3n2C2CCC(CC(C)C)C2)cc1	AlphaDrug	5L2S	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14898	CC(C)CC1CCC(n2c(-c3ccc(Cl)cc3)nc3ccccc32)C1	AlphaDrug	5L2S	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14899	CC(C)CC1CCCC(NC(=O)C2Oc3ccc(F)cc3CC2C(=O)NCc2ccccc2)CC1	AlphaDrug	5L2S	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14900	Cc1cc(Oc2ccc(C)c(CCCN3CCCC(c4noc(-c5ccccc5Cl)n4)NC(=O)NC3=O)c2)cc(C(F)(F)F)c1	AlphaDrug	6H29	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14901	Cc1cc(Oc2ccc(C)c(CCCN3CCCC(c4noc(-c5ccccc5)n4)NC(=O)NC3=O)c2)cc(C(F)(F)F)c1	AlphaDrug	6H29	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14902	Cc1cc(Oc2ccc(C)c(CCCC3CCC(NC(=O)NO)CC3)c2)cc(C(F)(F)F)c1	AlphaDrug	6H29	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14903	Cc1cc(Oc2ccc(C)c(CCC3CCCCCC3)c2)cc(C(F)(F)F)c1	AlphaDrug	6H29	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14904	Cc1ccc(-c2cc3cc(C(=O)NCc4ccccc4)c(C(N)=O)cc3o2)s1	AlphaDrug	6H29	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14905	Cc1cc(Oc2ccc(C)c(CN(CC(=O)O)S(=O)(=O)c3ccccc3)c2)cc(C(F)(F)F)c1	AlphaDrug	6H29	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14906	Cc1cc(Oc2ccc(C)c(CN3C=CC(NC(=O)NCc4ccc5c(n4)CCCCC5)CC3)c2)cc(C(F)(F)F)c1	AlphaDrug	6H29	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14907	Cc1cc(Oc2ccc(C)c(C)c2)cc(S(=O)(=O)N2CCCCC2)c1	AlphaDrug	6H29	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14908	Cc1cc(Oc2ccc(C)c(CCCN3CCCC(C(=O)NCc4ccccc4)NC(=O)c4cncnc4C3)c2)cc(C(F)(F)F)c1	AlphaDrug	6H29	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14909	Cc1cc(Oc2ccc(C)c(CCCN3CCCC(c4noc(-c5ccccc5)n4)NC(=O)NCC3=O)c2)cc(C(F)(F)F)c1	AlphaDrug	6H29	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14910	CC(C)(C)c1ccc(C(=O)Nc2cccc(Cc3ccc4ccc(C(F)(F)F)cc4c3)c2)cc1	AlphaDrug	4U54	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

14896 to 14910 of 73725 items. Total 4915 pages.